Organizirano šumsko sjemenarstvo u Hrvatskoj započelo je osnutkom Zavoda za kontrolu šumskog sjemena sa sjedištem u Rijeci. Glavna zadaća Zavoda bila je stručni nadzor nad proizvodnjom šumskog sjemena te ispitivanje kvalitete sjemena koje se stavlja u promet na području Republike Hrvatske. Osnovala ga je Poljoprivredno-šumarska komora 28. ožujka 1959. godine, a s radom je započeo 1. svibnja 1959.
Zavod je djelovao kao znanstveno-stručna ustanova do kraja 1973. godine, a 1. siječnja 1974. ujedinio se s Institutom za šumarska istraživanja iz Zagreba i Jugoslavenskim institutom za četinjače iz Jastrebarskog u jedinstveni Šumarski institut, Jastrebarsko. Zavod je pripojen Odjelu za oplemenjivanje i sjemenarstvo kao eksteritorijalna podjedinica u Rijeci. Godine 1992. laboratorij je preseljen u Jastrebarsko, gdje nastavlja s radom, a danas je dio Odjela za laboratorijska ispitivanja (OLI).
Poznavanje kvalitete šumskog sjemena omogućuje krajnjim korisnicima uporabu sjemena visoke kvalitete i služi kao smjernica tijekom proizvodnje, trgovine i skladištenja. Pod kvalitetom sjemena podrazumijeva se njegova genetička i analitička čistoća te fizičke i fiziološke osobine poput mase 1000 sjemenaka, sadržaja vlage, klijavosti, vitaliteta i zdravstvenog stanja. LIS za to koristi međunarodno priznate metode koje propisuju ISTA Rules.
Radi kvalitete usluga i konkurentnosti u LIS-u je uveden sustav upravljanja kvalitetom prema normi HRN EN ISO/IEC 17025. Akreditaciju provodi Hrvatska akreditacijska agencija (HAA): prva je dobivena 2008. za ciklus od pet godina, a reakreditacija je provedena 2013. i 2018. U svakom ciklusu HAA provodi tri redovita nadzora te na temelju nalaza produžuje akreditaciju.